RORB Data:

1 Results

1.1 1-d Heatmap

1.2 Location meda_plots

1.3 Outliers as given by randomForest

1.4 Correlation Matrix

1.5 Cumulative Variance with Elbows

1.6 Paired Hex-binned plot

1.7 Hierarchical GMM Classifications

1.8 Hierarchical GMM Dendrogram

1.9 Stacked Means

1.10 Cluster Means

2 Restricting hGMM to \(K = 2\)

Here we are restricting hierarchical GMM to only go through on level. We are comparing the cluster results to the gaba labels.

set.seed(314)
h2 <- hmc(sdat, maxDepth = 2, ccol = ccol, maxDim = 12)
h2lab <- viridis(max(h2$dat$labels$col))

2.1 K = 2 stacked means plot

stackM(h2, ccol = ccol, centered = TRUE, depth = 1)

2.2 Pairs plot colored by hGMM cluster classification

acols2 <- alpha(h2lab[h2$dat$labels$col], 0.5)
pairs(h2$dat$data, pch = 19, cex = 0.4, col = acols2)

3 NDVIZ links

3.1 NOMADS Synapse detections

Detection Centroids
20 55 30
34 42 12
48 44 16
61 40 24
47 63 28
59 50 19
62 62 21
26 44 40
8 57 33
30 52 36
19 50 40
49 34 40
52 46 41
51 59 40
71 7 11
83 8 8
90 24 11
68 9 28
87 13 20
87 6 31
85 31 19
105 6 9
99 10 12
121 30 9
96 9 30
117 9 31
104 30 16
102 31 24
125 28 22
113 18 30
70 37 23
80 40 19
87 42 18
89 46 27
70 49 18
80 62 18
83 55 26
115 39 15
108 49 9
121 50 10
121 59 11
97 45 31
105 42 30
108 62 17
100 60 27
74 19 36
71 31 36
92 20 36
95 31 33
123 9 43
99 17 36
105 22 35
103 23 42
64 37 39
86 34 38
94 37 40
68 59 32
65 52 43
76 54 41
84 57 34
92 56 41
109 37 35
106 46 43
121 36 36
112 33 43
127 61 32
119 56 43
112 63 40
8 87 12
21 93 7
12 70 23
9 82 20
19 89 21
21 84 26
31 94 26
52 76 14
56 83 9
33 70 20
59 78 20
44 92 21
46 85 31
43 93 27
56 90 29
14 97 15
31 99 6
18 107 11
25 111 12
8 112 7
8 127 14
25 126 10
8 111 16
12 108 20
9 98 29
8 110 25
20 103 22
6 124 20
12 118 28
26 119 26
28 124 26
47 98 9
52 109 6
57 102 11
46 112 6
39 127 11
59 125 6
34 103 20
45 107 18
39 98 31
53 110 23
62 110 16
58 100 24
47 119 26
34 125 26
42 121 28
59 118 17
9 72 32
13 73 43
16 65 33
24 74 39
14 83 32
19 92 37
45 77 32
41 67 43
61 75 34
13 102 42
7 111 43
23 100 38
22 125 36
47 111 35
54 97 38
32 124 35
42 123 36
53 124 39
69 66 7
79 76 6
70 64 15
75 70 13
90 71 15
85 79 12
71 89 10
72 73 23
87 76 27
79 95 21
66 82 26
83 87 26
93 88 29
99 76 14
100 87 8
120 82 9
126 88 13
107 76 31
119 70 22
121 67 16
113 73 27
99 81 23
125 82 22
118 93 19
64 100 12
73 111 8
94 109 6
89 102 12
67 123 7
70 126 14
64 96 31
76 107 26
90 109 29
87 121 21
96 96 15
97 119 14
126 124 14
109 105 23
97 97 29
114 111 20
116 101 26
115 122 21
116 126 29
89 66 34
91 78 43
67 82 39
77 91 35
91 95 33
92 90 37
89 89 41
99 75 36
108 73 40
120 72 36
105 85 37
119 92 33
115 91 41
81 101 39
66 117 34
77 112 34
71 120 41
109 104 39
98 114 39
106 113 35
139 10 8
157 8 14
136 21 14
145 17 6
144 28 7
152 25 15
131 6 20
137 11 27
137 26 18
170 14 7
163 14 12
171 15 14
180 11 9
164 22 13
189 19 15
168 10 21
161 8 24
177 27 30
133 37 9
152 36 11
144 44 11
146 32 18
146 33 31
156 41 24
133 49 23
137 63 21
145 56 18
152 53 27
166 58 13
189 50 7
168 35 19
175 46 31
189 33 21
171 61 22
183 58 17
142 16 39
143 25 32
157 31 39
160 20 37
169 22 34
182 17 43
135 44 36
143 32 42
147 48 41
150 52 40
170 41 41
189 38 41
199 8 10
200 20 11
214 11 25
199 30 22
205 30 20
194 22 27
218 22 23
208 18 27
223 21 28
209 29 28
227 19 6
241 17 12
253 22 11
238 7 31
234 31 21
249 16 26
201 39 13
221 46 8
205 52 9
203 35 25
199 40 28
210 39 21
207 57 21
209 57 17
242 34 8
240 45 10
229 50 12
237 61 13
225 32 22
225 47 20
234 44 29
243 45 22
246 58 27
254 56 24
220 8 43
193 26 35
206 24 32
222 30 35
233 15 33
226 17 43
254 21 43
213 43 33
212 56 35
227 37 36
245 38 36
130 65 6
141 72 6
136 66 12
149 84 10
144 68 17
144 77 26
150 76 28
136 80 21
129 94 20
130 91 26
152 91 20
156 84 24
148 91 30
171 65 8
164 92 7
181 81 15
189 90 15
160 67 22
175 90 19
162 93 29
184 93 25
133 109 12
159 106 7
134 127 13
158 113 15
148 125 8
133 103 18
142 104 18
132 109 28
148 103 18
145 108 26
152 109 26
128 116 27
147 121 18
156 120 21
171 103 6
175 99 13
170 127 7
187 115 11
175 99 21
169 101 24
173 98 29
187 107 22
168 112 23
165 118 29
189 125 21
138 73 35
156 72 32
136 92 42
152 94 39
129 102 39
128 110 37
144 105 39
138 112 34
134 121 36
143 124 35
149 118 34
155 112 39
153 122 38
163 110 40
175 116 37
172 121 39
188 119 40
178 123 40
198 70 15
209 75 10
194 83 6
222 90 12
216 68 17
208 68 25
200 95 30
220 83 22
217 90 28
237 72 6
235 73 19
229 73 29
243 75 20
232 83 20
254 85 16
242 95 17
240 85 27
249 81 31
252 93 29
216 97 6
212 119 13
205 99 20
209 110 21
217 105 22
201 122 18
240 100 6
240 107 12
242 116 7
230 107 25
247 100 31
234 116 18
227 126 16
226 121 23
243 125 20
219 78 40
220 86 36
235 84 39
240 93 37
197 103 32
207 105 36
214 102 36
204 122 32
229 109 37
251 106 35
229 126 43
9 135 11
17 132 15
29 140 15
6 156 10
27 150 9
14 138 31
23 132 17
22 135 22
18 141 20
9 157 24
31 154 23
54 132 14
62 140 10
43 142 17
53 128 26
61 132 24
41 152 17
46 159 28
50 148 18
60 145 28
12 164 12
18 170 14
6 182 11
24 165 21
18 161 30
18 178 26
43 162 9
14 142 43
23 134 34
30 134 34
12 150 34
28 151 33
26 155 43
38 133 32
46 135 32
32 143 38
39 147 36
46 155 36
10 160 38
14 171 35
30 165 34
23 173 36
28 168 41
8 178 37
36 165 43
44 162 41
66 149 6
87 150 7
94 150 6
80 154 7
88 157 15
76 136 26
92 137 22
87 130 25
67 147 23
65 153 17
70 150 30
80 153 16
84 152 24
113 131 7
120 128 7
107 159 6
107 147 14
126 148 8
102 128 29
98 149 18
105 158 19
113 149 30
81 162 8
85 162 30
93 171 24
100 178 14
116 179 12
114 187 12
98 169 20
111 176 19
98 190 19
100 181 26
127 191 19
112 189 28
72 138 36
78 142 43
105 136 38
102 129 40
98 142 43
120 137 40
126 158 37
67 162 39
95 166 35
95 167 43
92 174 41
109 166 32
104 164 36
102 172 37
116 162 40
99 183 35
10 203 7
6 193 26
12 242 12
19 249 14
6 242 19
6 252 21
10 240 29
33 249 21
10 205 36
7 246 37
15 253 35
48 255 41
119 201 8
123 200 14
108 217 10
114 218 8
125 218 12
126 194 31
97 222 19
102 209 24
99 218 25
120 208 27
118 221 24
94 233 14
80 252 7
88 255 13
87 233 22
93 234 24
92 237 30
69 244 19
77 243 25
79 255 27
83 249 16
93 247 30
124 234 14
98 246 6
107 237 16
105 236 30
126 225 25
119 238 25
108 249 19
123 245 28
116 248 25
122 255 27
104 203 35
116 193 41
103 222 36
120 211 37
114 221 36
127 208 40
120 222 41
87 244 34
94 254 40
99 234 38
124 231 33
104 240 37
116 246 36
129 138 10
157 136 7
154 129 8
154 144 9
153 159 13
128 130 18
136 131 23
144 132 28
145 143 28
132 150 25
148 158 19
178 143 7
188 151 6
187 146 8
182 155 14
163 133 17
172 138 31
178 128 30
170 154 29
181 148 24
143 162 7
156 167 9
134 179 7
148 178 12
156 179 8
147 191 12
137 170 23
132 182 22
138 176 16
148 183 24
159 187 25
168 160 6
185 166 13
187 181 7
175 167 18
171 166 26
186 168 23
189 168 29
188 178 19
186 183 28
159 141 35
150 133 41
144 144 36
149 150 36
151 154 42
162 128 36
188 131 38
181 137 38
169 148 40
181 154 36
133 162 32
140 160 35
148 160 36
149 170 35
128 183 33
134 191 32
140 187 37
153 179 38
150 187 40
168 165 36
188 172 40
164 176 40
176 187 35
188 183 43
177 190 43
198 136 12
210 136 9
205 146 9
198 156 11
222 153 12
192 140 18
202 133 27
220 132 27
205 150 29
207 157 29
220 148 20
233 132 14
231 145 12
234 157 14
253 151 11
224 138 27
231 143 26
251 140 27
230 156 19
194 172 13
207 170 12
206 182 7
192 187 12
202 189 8
208 187 13
215 168 22
197 188 22
196 180 26
203 179 30
210 187 21
218 189 16
242 169 15
224 180 13
233 183 9
236 188 14
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